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青海新聞網(wǎng)·大美青�？蛻舳擞� 記者從青海省科技廳了解到，11月12日，中國科學(xué)院西北高原生物研究所研究員張同作聯(lián)合青海大學(xué)副教授魏青等團(tuán)隊(duì)，成功組裝了藏羚染色體級別的基因組，首次獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息，相關(guān)研究結(jié)果在《自然》旗下綜合性科學(xué)期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》上發(fā)表。
研究團(tuán)隊(duì)基于PacBio HiFi三代基因組測序、Hi-C測序和DNBSEQ-T7二代基因組survey測序三種測序技術(shù)，成功組裝了藏羚染色體級別的基因組。基于EDTA和RepeatModeler從頭預(yù)測的藏羚基因組中重復(fù)序列注釋結(jié)果表明，藏羚基因組重復(fù)序列主要由SINEs、LINEs、LTRs和DNA transposons四種類型組成，序列總長度為1.65Gb，占基因組的52.47%；基于蛋白同源預(yù)測、蛋白從頭預(yù)測和深度學(xué)習(xí)等多種策略，在藏羚基因組上共注釋到28330個功能基因。
研究團(tuán)隊(duì)首次獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息，為藏羚的適應(yīng)進(jìn)化遺傳機(jī)制、保護(hù)遺傳學(xué)研究及進(jìn)一步探索物種遷徙行為的遺傳機(jī)制提供了重要的基因組資源。