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青海省昆侖英才農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新團隊
學術(shù)論文在《Scientific Data》上發(fā)表
作者:張小千
發(fā)布時間:2025-02-26 23:40:00
編輯:張小千

  青海新聞網(wǎng)·大美青?蛻舳擞崳ㄓ浾 張小千 報道)近日,記者從青海省科技廳獲悉,由青海省科技廳重點研發(fā)與轉(zhuǎn)化計劃專項支持的青海大學青海省昆侖英才農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新團隊(青藏高原昆蟲生態(tài)與害蟲防治團隊),在自然科學期刊《Scientific Data》(科學數(shù)據(jù))上發(fā)表學術(shù)論文《Genome assembly of the grassland caterpillar Gynaephora qinghaiensis》(青海草原毛蟲基因組組裝)。

  草原毛蟲(Lepidoptera:Lymantriinae:Gynaephora)是一個小型昆蟲類群,全世界記錄有15個物種,分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區(qū)。在中國,所有8個被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900米至5000米的青藏高原地區(qū)。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲,不僅取食牧草可導致嚴重的飼草短缺和草地退化,還會引起家畜和野生動物的口腔黏膜潰瘍。

  研究組就青海草原毛蟲(Gynaephora qinghaiensis)的基因組進行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04Mb,由107個contig組成,contig N50大小為18.65Mb。BUSCO分析顯示,組裝體中含有99.56%(99.27%完整、0.29%片段化)的BUSCO基因。在G.qinghaiensis基因組中,預測有580.2Mb(占基因組的67.4%)的重復序列和16 618個蛋白質(zhì)編碼基因。系統(tǒng)發(fā)育基因組學分析表明,G.qinghaiensis與銹色卷蛾Orgyia antiqua大約在1830萬年前分化。此外,基因家族進化分析表明,在G.qinghaiensis基因組中,有130個基因家族顯著擴張、43個基因家族收縮。參考基因組的可用性,可為揭示草原毛蟲對高海拔環(huán)境的適應性進化機制提供遺傳資源,有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。

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  研究組就青海草原毛蟲(Gynaephora qinghaiensis)的基因組進行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04Mb,由107個contig組成,contig N50大小為18.65Mb。BUSCO分析顯示,組裝體中含有99.56%(99.27%完整、0.29%片段化)的BUSCO基因。在G.qinghaiensis基因組中,預測有580.2Mb(占基因組的67.4%)的重復序列和16 618個蛋白質(zhì)編碼基因。系統(tǒng)發(fā)育基因組學分析表明,G.qinghaiensis與銹色卷蛾Orgyia antiqua大約在1830萬年前分化。此外,基因家族進化分析表明,在G.qinghaiensis基因組中,有130個基因家族顯著擴張、43個基因家族收縮。參考基因組的可用性,可為揭示草原毛蟲對高海拔環(huán)境的適應性進化機制提供遺傳資源,有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。

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